生物樣本庫絕不僅限于儲存,更重要的含義是資源的應(yīng)用和共享,利用龐大和詳細的樣本數(shù)據(jù)為人類健康服務(wù)。然而,我國的生物樣本庫卻一直傾向于單兵作戰(zhàn),共享機制在國內(nèi)遲遲未能建立。
“沒有信息轉(zhuǎn)化,生物樣本庫建設(shè)意義將成空談。”在全球熱議生物樣本庫之際,其國內(nèi)短板被上海交通大學醫(yī)學院附屬新華醫(yī)院教授王偉業(yè)一語戳中。
生物樣本庫又稱“生物銀行”,但它存儲的不是錢,而是組織、血液、細胞、DNA等生物樣本以及與其相關(guān)的臨床資料及其質(zhì)量控制信息管理與應(yīng)用系統(tǒng)。
王偉業(yè)日前在第二屆生物樣本庫與臨床研究論壇上指出,生物樣本庫絕不僅限于儲存,更重要的含義是資源的應(yīng)用和共享,利用龐大和詳細的樣本數(shù)據(jù)為人類健康服務(wù)。然而,我國的生物樣本庫卻一直傾向于單兵作戰(zhàn),共享機制在國內(nèi)遲遲未能建立。
不該有的“防守”態(tài)度
我國疾病生物樣本資源極其豐富,是任何一個國家無可比擬的。比如,我國一個月的就診數(shù)量就相當于國外幾個月積累的病例數(shù),而整個歐洲的例數(shù)甚至少于我國一家三甲專科醫(yī)院。
目前,我國國家基因庫已經(jīng)擁有3000萬份人、動植物和微生物樣本,被稱為世界級的生物樣本庫和組學數(shù)據(jù)庫。然而,僅有資源完全不夠,生物樣本庫在我國仍呈分散、獨立、無序的狀態(tài)。從樣本庫的質(zhì)量安全控制到信息化資源整合與共享,國內(nèi)與國外存在較大差距。
“我國業(yè)內(nèi)人士在參觀某個生物樣本庫時,總是看有多大空間,多少冰箱,用什么儀器,有幾個人等,信息化問題很少有人關(guān)注。”王偉業(yè)稱,樣本資源的應(yīng)用與研究結(jié)合、信息共享為前提的資源共享等問題在國內(nèi)并未得到解決。
在上海交通大學醫(yī)學院附屬精神衛(wèi)生中心教授崔東紅看來,生物樣本庫是個靜態(tài)名詞,這就很可能造成概念上的誤解:如同倉庫一樣只具備儲存功能。
其實,生物樣本庫與傳統(tǒng)生物資源保存最根本的區(qū)別是樣本的信息化,建設(shè)現(xiàn)代生物樣本庫的目的也是如何把生物樣本資源轉(zhuǎn)化或翻譯成可以共享的數(shù)據(jù)信息資源。
“但是,大部分人一談到共享,總會覺得是別人拿了自己的東西,大多采取防守的態(tài)度來回避共享機制的建立。”王偉業(yè)覺得生物樣本庫在國內(nèi)更傾向于單兵作戰(zhàn),殊不知真正能夠展示生物樣本庫價值的是共享信息,及一個有價值和管理規(guī)范的數(shù)據(jù)庫。
“因為有信息,我們才收集樣本;因為可以獲取更有價值的信息,我們才保存樣本;因為樣本和信息可能回答問題,我們才應(yīng)用樣本。從根本上說,我們使用的是由樣本獲取的數(shù)據(jù)信息。”王偉業(yè)說。
如何讓沙子變黃金
數(shù)據(jù)就像沙子,單個來看也許毫無價值可言,沒有進行技術(shù)辨別、提純的時候,它們就是一盤散沙。但是當數(shù)據(jù)量足夠大,并且有技術(shù)能夠把它們利用起來時,這些數(shù)據(jù)的價值就會急劇上升,猶如沙子變成了黃金。
隨著生命科學及轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究的不斷深入,王偉業(yè)相信,未來人們再談生物樣本庫時,重點會轉(zhuǎn)移到樣本庫的信息化建設(shè)上。
如何打造信息時代下的生物樣本庫,復(fù)旦大學生物醫(yī)學研究院教授劉雷認為,有序的空間管理才是樣本庫信息化管理的初衷,而條形碼等技術(shù)手段是信息管理所必不可少的。
“當樣本量積累到一定程度時,手工管理會變得很凌亂,極易造成錯誤。在這種情況下,應(yīng)用條形碼等技術(shù)可以準確定位每個樣本,使空間管理自動化”劉雷指出,在樣本的收集、處理、出/入庫等操作流程中,應(yīng)用條形碼等技術(shù)還可在樣本庫信息系統(tǒng)中準確了解樣本的狀態(tài),使管理自動化。
要想做到信息共享,劉雷認為引入云信息管理系統(tǒng)也是重要前提。生物樣本庫在共享機制下建立一個基于網(wǎng)絡(luò)化的樣本公共平臺,囊括多家網(wǎng)絡(luò)單位的生物樣本庫信息,可以實現(xiàn)樣本臨床數(shù)據(jù)、科研數(shù)據(jù)即時反饋,從而促進科研合作共享,提高樣本的使用效率。
另外,數(shù)據(jù)安全也是樣本庫信息管理中的重要部分,這就要求樣本庫信息系統(tǒng)有較完善的權(quán)限管理功能和操作記錄功能,可追蹤數(shù)據(jù)操作中的每一步。
北京大學腫瘤醫(yī)院教授呂有勇則認為,許多生物樣本采集工作基本上是根據(jù)科研工作的需要,由醫(yī)療機構(gòu)和科研人員自發(fā)開展的,缺乏專業(yè)和系統(tǒng)的設(shè)計與規(guī)范,因此生物樣本庫還應(yīng)該基于大數(shù)據(jù)時代的特征進行建設(shè)。
“大數(shù)據(jù)是獲得新認知和創(chuàng)造新價值的源泉,并將海量的生物樣本數(shù)據(jù)進行智能分析和科學利用。”呂有勇說。
質(zhì)量是樣本庫的靈魂
業(yè)界共識是,保證樣本的質(zhì)量才是生物樣本庫信息化建設(shè)的前提。在此次會議上,與會專家還共同呼吁,由政府組織,主動、集中地打造有序、可控、符合國際標準、高質(zhì)量、珍貴且可充分利用、產(chǎn)生重大應(yīng)用價值的生物樣本庫勢在必行。
“樣本的質(zhì)量是樣本庫的靈魂,沒有質(zhì)量的樣本給研究結(jié)果帶來的負面影響要在相當長的時間內(nèi)才能消除。”復(fù)旦大學附屬腫瘤醫(yī)院教授杜祥發(fā)出警告。
如何開展生物樣本庫的質(zhì)量管理,杜祥認為,樣本庫的質(zhì)量管理需要嚴格的操作流程作為保障,建立樣本庫標準作業(yè)程序(SOP)至關(guān)重要。
來自上海醫(yī)藥(601607,股吧)臨床研究中心的范錦立博士也持類似觀點。他認為樣本庫的運營應(yīng)嚴格按照SOP,參加專業(yè)機構(gòu)組織的抽樣質(zhì)控和檢查,持續(xù)改進樣本庫的質(zhì)量管理。另外,關(guān)注樣本操作流程的質(zhì)量控制點也非常重要,特別是溫度監(jiān)控以及核酸和細胞等物質(zhì)的質(zhì)量控制。
崔東紅則表示,個性化是生物樣本庫質(zhì)量的靈魂,要根據(jù)不同疾病特征建設(shè)有特色的個性化樣本庫。與此同時,穩(wěn)步發(fā)展是樣本質(zhì)控的方向,在滿足和保證質(zhì)量的前提下,有計劃地擴大庫存量,不可一味要求樣本庫存量。